Azon intézmények, amelyek nem írták alá az új ellátási szerződést, nem vehetnek részt fejlesztési pályázatokon, továbbá esetükben a korábbi finanszírozási rend marad érvényben, azaz kevesebb forrásból gazdálkodhatnak. Megszűnik a fővárosi Schöpf-Merei Ágost Kórház és Anyavédelmi Központ, az Országos Pszichiátria és Neurológiai Intézet (OPNI), a Svábhegyi Állami Gyermekgyógyintézet.

Csak krónikus ellátást biztosító intézmény 53 lesz az országban. Az összágyszám 80.125-ről 71.324-re csökken, ezen belül az aktív ágyak száma 16 ezerrel csökken, a krónikusaké hét és fél ezerrel nő. Az Egészségügyi Minisztérium az ágyszám-csökkentést azzal indokolta, hogy azok negyede kihasználatlan.

A tervek szerint minden megyében lesz legalább egy kiemelt kórház, amelyek egyúttal sürgősségi központként is működnek. Kiemelt kórház lesz a két legsúlyosabb népbetegséget gyógyító országos intézet is: a Kardiológiai és az Onkológiai Intézet. A intézmények többsége területi kórházként működik majd, ahol az aktív ellátás mellett a jövőben a jelenleginél nagyobb szerep jut majd a rehabilitációnak, illetve a krónikus ellátásnak.