Az eredeti tagok nagy része kelet-európai menekült volt. A zenekart a csernobili katasztrófa után Ukrajnából kitelepített Eugene Hütz alapította. Lengyelországban, Magyarországon, Olaszországban és Bécsben élt menekültként, majd New Yorkban telepedett le. Itt találkozott Vlad Solofar gitárossal valamint Sasha Kazachkoffal és Eliot Fergusennel. Tagja lett a zenekarnak Szergej Rjabcev volt moszkvai rendező, aki segített kialakítani az együttes bizarr showját.

A Gogol Bordello a cigány és kelet-európai zenét népszerűsíti az angolszász területeken. A "Bordello" szó a barátságra, az "ugyanabba a klubba való tartozáshoz" utal. A csapat neve eredetileg Hütz és a Béla Bartóks volt, ezt sokan nem értették, s ekkor választották a jelenlegi nevüket egy ukrán, bizonyos Nyikolaj Gogol javaslatára.

Hamarosan a New York-i külvárosi hippik kedvencei lettek. Gitárosuk, Jurij Lemesev Szahalin szigetéről disszidált a tengerentúlra. Egy ideg tagja volt a társulatnak az izraeli Kaplan-testvérpár - ők még színesebbé tették az együttest.

Első kislemezüket 1999-ben jelentették meg, amelyet összesen nyolc album, köztük négy stúdiólemez követett. Különcségükre Madonna is felfigyelt, akivel Hütz és Rjabcev fellépett Londonban a Live Earth koncerten a La Isla Bonita című dalban.

Az első európai turnéjuk után Rea Mochiach basszusgitáros, valamint Pam Racine és Elizabeth Sun, a két dobos-táncos lány érkezett.

Legutóbbi albumuk a Super Taranta!, amely ha lehet, még jobban sűríti az etno-punk-cigány-keleti-popzene elemeit.

A Gogol Bordello legutóbb az A38 hajón lépett fel novemberben, korábban a Szigeten aratott sikert. A zenekar minden egyes fellépése hatalmas show. Koncertjeiken billentyűs-, különféle fúvóshangszereket, továbbá hegedűt is megszólaltatnak.